TMS tedavisi uygulanamayacak tek insan grubu beyin ameliyatı olmuş ve beynine ferromanyetik bir metal parçası (stent ya da klips vb.) yerleştirilmiş kişilerdir. Ayrıca epilepsi hastalarında TMS tedavisi sırasında epileptik bir nöbet indükleme ihtimali vardır. Bu yüzden epilepsi hastalarında doktorunuz sizin için yarar-zarar değerlendirmesi yapacak ve uygulanabilirliğine karar verecektir.
